我所解析重要果树害虫桃小食心虫基因组

发布时间：2020年10月27日 09:50　　浏览次数：1788

桃小食心虫是苹果、梨、桃等果树上的重要害虫，生产上主要通过套袋进行防控，由于缺乏有效防控措施，该虫的危害成为当前制约果实免套袋栽培的重要因素（图1）。国内外主要从发生动态、滞育特性、遗传分化及环境适应性等方面进行研究，高质量基因组的解析将进一步推动相关领域的研究进展，以期为该虫的预测预报和防控技术研究提供科学依据。

我所曹利军博士等研究人员采用Illumina、PacBio测序平台和Hi-C技术对桃小食心虫基因组进行测序，通过团队搭建的分析流程完成了染色体水平的基因组组装和注释，获得30条常染色体和一条Z染色体，BUSCO评估完整度为98.3%（图2）。对昼夜节律基因、解毒基因和化学受体基因家族进行了注释，发现桃小食心虫除了谷胱甘肽S-转移酶（GST）基因的数量较多以外，其它解毒基因家族基因数量和化学受体基因数量均低于大部分鳞翅目昆虫。这是目前测定的第一个蛀果蛾科昆虫的全基因组，丰富了对鳞翅目昆虫基因组特征与演化的认识。

研究论文在国际知名刊物Molecular Ecology Resources上发表，基因组数据已在NCBI数据库公开（BioProject PRJNA627116）。

曹利军博士为论文第一作者，客座研究生宋威、博士后郭韶堃、博士后岳雷、宫亚军副研究员、陈金翠助理研究员和澳大利亚墨尔本大学Ary Hoffmann教授等为论文共同作者，魏书军研究员为论文通讯作者。

该项研究得到国家自然科学基金、北京市自然科学基金、北京市农林科学院-墨尔本大学害虫防控研究联合实验室、北方果树病虫害绿色防控北京市重点实验室项目的资助。

全文链接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1755-0998.13288

图1. 桃小食心虫卵、幼虫、茧（蛹）和成虫的特征（A-D）及对苹果的危害状（E-G）

图2. 桃小食心虫基因组特征（a）、连锁群（b）及其与斜纹夜蛾（c上）和苹果蠹蛾（c下）基因组的共线性分析